2013年首都医科大学计划招收硕士研究生约730人，报名参加我校硕士研究生选拔的考生共有3178人。
根据教育部划定的基本合格分数线及参加复试人数比例要求（进入复试的考生人数应占计划人数的120％），首都医科大学研究生招生工作组依据我校考生初试成绩情况确定2013年我校复试分数线为：
1.全国统考硕士研究生复试分数线
| 门类（代码） | 专业名称 | 我校复试分数线 | ||
| 总分 | 单科 （满分=100分科目） | 单科 （满分>100分科目） | ||
| 教育学（04） | 应用心理学 | 310 | 40 | 120 |
| 理学（07） | 生物学、药学部分专业（药物化学078001、药剂学078002、药物分析学078004、药理学078006） | 290 | 39 | 59 |
| 工学（08） | 计算机应用技术、生物医学工程 | 295 | 40 | 60 |
| 管理学（12） | 社会医学与卫生事业管理 | 345 | 51 | 77 |
| 医学（10） | 基础医学、公共卫生与预防医学、药学部分专业（生药学100703、药理学100706）、中药学、精神病与精神卫生学 | 290 | 38 | 114 |
| 口腔医学 | 295 | 50 | 183 | |
| 临床医学（学术型、专业学位）、护理学 | 300 | 50 | 180 | |
| 中医学、中西医结合 | 275 | 36 | 108 | |
| 总分 | 单科 | 单科 | 单科 |
| 满分=100分 | 满分=150分 | 满分=300分 | |
| 排名为前10名 | 55 | 83 | 165 |
